自动化医学编码是将临床注释编码为适当诊断和程序代码的一个过程，该过程会自动从ICD（国际疾病国际分类）和CPT（当前程序术语）中自动制定。手动编码过程涉及从临床注释中识别实体，然后查询遵循Medicare和Medicaid Services中心（CMS）指南的商业或非商业医学法规信息检索（IR）系统。我们建议通过使用从临床注释自动提取的实体自动构造IR系统的查询来自动化此手动过程。我们提出\ textbf {grabqc}，a \ textbf {gra} ph \ textbf {b} ased \ textbf {q} uery \ textbf {c} onTextualization方法，该方法自动从临床文本中提取查询，从而使用临床文本提取质量，并在图形上提取质量网络（GNN）模型并使用外部IR系统获得ICD代码。我们还提出了一种标记用于训练模型的数据集的方法。我们在三个不同的设置中对两个临床文本数据集进行实验，以主张我们方法的有效性。实验结果表明，我们所提出的方法比所有三个设置中的基准都更好。